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在linux服务器上使用R语言及Rstudio server
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cat /etc/redhat-release: 查看服务器系统版本
wget
checking for rl_callback_read_char in -lreadline... no
configure: error: --with-readline=yes (default) and headers/libs are not available
configure: WARNING: you cannot build info or HTML versions of the R manuals
configure: WARNING: you cannot build PDF versions of the R manuals
configure: WARNING: you cannot build PDF versions of vignettes and help pages
6.安装
make
make install
安装成功!
R #在命令行直接输入“R”即可进入R 编辑。
q() ##退出R编辑
7.安装R-studio-server
wget
yum install rstudio-server-rhel-1.2.1335-x86_64.rpm
8.R-studio-server的一些命令
rstudio-server start ##启动 rstudio
rstudio-server stop ## 关闭rstudio
rstudio-server status ## 查看rstudio 运行状态
运行rstudio-server status出现 “Active: active (running) ” 表示rstudio 已启动
rstudio-server verify-installation ## 查看rstudio 安装错误
rstudio-server restart ##重启
ifconfig ##查看服务器ip地址。
查看运行中R进程
rstudio-server active-sessions
指定PID,停止运行中的R进程
rstudio-server suspend-session pid
停止所有运行中的R进程
rstudio-server suspend-all
强制停止运行中的R进程,优先级最高,立刻执行
rstudio-server force-suspend-session pid
rstudio-server force-suspend-all
RStudio Server临时下线,不允许web访问,并给用户友好提示
rstudio-server offline
RStudio Server临时上线
rstudio-server online
8.rstudio-server系统设置
主要有两个配置文件,默认文件不存在(非必要,可不做修改)
/etc/rstudio/rserver.conf
/etc/rstudio/rsession.conf
vi /etc/rstudio/rserver.conf
www-port=8080#监听端口,默认是8787,可以不做修改
www-address=127.0.0.0#允许访问的IP地址,默认0.0.0.0
rstudio-server restart
vi /etc/rstudio/rsession.conf
session-timeout-minutes=30#会话超时时间
r-cran-repos= #CRAN资源库
rsession-which-r=/usr/local/bin/R ## 如果非root安装,更改R所在目录。
9.通过浏览器连接Rstudio-server
直接打开浏览器,输入;服务器ip:8787 ## 如果修改过rserver.conf文件,后面的8787端口改为相应的端口即可。
这里需要我们输入用户名和密码。关于用户名有2点注意事项:
(1).不允许使用system 用户登陆,即用户ids小于100的用户。只能用普通用户登录
(2).用户的认证可以使用RSA。
如果没有普通用户,可以添加:
useradd newname # 添加一个名为newname的用户
passwd newname ###给新用户newname 设置密码,密码需是复杂密码,否则可能通不过。
usermod -G happy newname ####将新用户newname添加到happy 用户组中,
在用useradd添加用户之后,在默认的情况下,该账号是暂时被封锁的, 也就是说,该账号是无法登录,须要用passwd命令来给新创建的用户设置密码之后才可以使用。
10可能存在的问题
10.1如果你的rstudio-server没有启动 很大程度是安装有误,这里我将我遇到的错误分享出来
rstudio-server verify-installation
There is a libR.so in /usr/lib/R/lib, but (weirdly) ls -l reveals that
it dates from the my previous install of R-3.5.1 for which I did not
configure with --enable-R-shlib.
这里就提到无法找到libR.so文件,原因是配置R语言文件时,没有加参数--enable-R-shlib.
这就必须要重新安装R语言。使用make uninstall 删除之前的安装,最好也删除R-3.6.1所在的文件夹,用“rm -r -f R-3.6.1".
使用rm 命令 -r 参数表示全部删除, -f 参数表示强制删除,不会提醒。 同时使用这两个参数要小心。
10.2 普通用户无法启动rstudio-server
sudo rstudio-server start## 以管理员方式执行命令
这时会需要输入密码并提示
xxx is not in the sudoers file.This incident will be reported.
如果不想出现上面的提示,就是给该用户提高权限,添加用户使用sudo的权利。
su root ###切换到root用户,如果有root权限的话。
chmod u+w /etc/sudoers ###添加sudo文件的写权限
vi /etc/sudoers ###编辑sudoers文件,添加权限。
找到这行 root ALL=(ALL) ALL,在他下面添加xxx ALL=(ALL) ALL (这里的xxx是你的用户名)
youuser ALL=(ALL) ALL
%youuser ALL=(ALL) ALL
youuser ALL=(ALL) NOPASSWD: ALL
%youuser ALL=(ALL) NOPASSWD: ALL
chmod u-w /etc/sudoers ##撤销sudoers文件写权限
在linux操作系统中读取权限的英文字符是r。根据查询相关资料信息显示,linux使用9位字母来表示权限,当使用命令ls时会显示目录或者文件的权限。r代表读权限,w代表写权限,x代表执行权限。
你好,首先你要知道rm命令只能删除文件。所谓的拷贝目录是拷贝主目录的执行权限,并不是指传统拷贝的意思。-r是删除目录,-R是删除目录及其子目录(意思就是目录还有目录的话用-r是删除不了的),简单地说是你现在删除A目录,里面只有文件,那么你可以使用
rm
-rf
命令,-f是不再询问确定删除。要是A目录里还有一个B目录(以此类推B目录里有C目录),那么你必须使用rm
-Rf
命令,-R是递归的意思,顾名思义就是一个个删除目录。希望能帮到你,谢谢